同位素骨扫描对诊断急性骨髓炎很有用，但对慢性骨髓炎用处则不大，因为急性骨髓炎平片一般没有异常表现。骨内血流增加的区域或成骨活性增加的区域在锝99骨扫描上表现为吸收增加，但没有特异性。但是，该检查有很大的阴性排除作用，虽然也有假阴性的报告。镓扫描在白细胞或细菌聚集区表现为吸收增加。如果镓扫描正常，则可以肯定没有骨髓炎，在术后用镓扫描随诊也很有用。铟111标记白细胞扫描比锝扫描和镓扫描敏感，在鉴别慢性骨髓炎和糖尿病性神经病足方面非常有用。