在进行治疗前明确急性骨髓炎的病原菌非常重要。获取病原菌的方法包括：骨髓炎部位穿刺引流液，清创获取的标本，血常规等。有学者推荐，对骨髓炎患者，常规进行血培养，以明确骨髓炎病原菌类型，但需要注意的是，血培养或穿刺部位脓液培养阴性并不能除外骨髓炎感染，因上述检测方法只有40-70%的阳性率。