全身治疗和局部治疗都不容忽视，膝关节是表浅关节，容易早期发现病变。因此，单纯性滑膜结核病例绝大部分是可以治愈的，带可以保留全部或大部分关节功能。关节腔内抗结核药物局部注射方法：先进行抽吸关节积液，再将结核药物直接注入关节腔内。成人可注入异烟肼每次200mg，儿童减半，也可注入链霉素，成人1g,儿童0.5g，每周注射1-2次，3个月为1疗程。如果滑膜肿胀厉害，抽不到液体，也可以穿刺部位注入药物。经过局部药物治疗后，如果积液少，色泽转清时可以继续治疗；如果不见好转，滑膜肿胀肥厚，可实行滑膜切除术。
对膝关节结核患者实行滑膜切除术一般仅作滑膜大部分切除术，保留半月板和交叉韦。术后继续关节腔内给以抗结核药物，在作滑膜切除术时往往会发现病变的实际情况比术前估计的要重些，此时要及时更改手术方法。
全关节结核病例，如果破坏进展明显，或有脓液积聚，需作病灶清除术。对于病灶清除术后是否要作膝关节融合术目前并无定论。一般认为，15岁以下的儿童、或在病灶清除术后尚有部分关节软骨面残留的成人病例可以不作融合术，15岁以上关节毁损严重并有畸形者，在病灶清除术后，同时行膝关节加压融合术，有窦道或有屈曲挛缩者均宜作融合术，加压钢针一般在4周后拔除，改用管型石膏至少2逐步形成月。不认手术治疗或非手术治疗，局部抽动十分重要，固定时间不少于3个月。